Izomery cis i trans to rodzaje izomerów geometrycznych, które powstają w wyniku różnych rozmieszczeń przestrzennych podstawników wokół wiązania podwójnego lub w strukturze pierścieniowej w cząsteczkach organicznych. Kluczowa różnica między izomerami cis i trans polega na rozmieszczeniu podstawników względem siebie.
W izomerach cis podobne lub identyczne podstawniki są umieszczone po tej samej stronie wiązania podwójnego lub struktury pierścieniowej. To przestrzenne rozmieszczenie skutkuje konfiguracją, w której podstawniki są bliżej siebie po jednej stronie cząsteczki.
I odwrotnie, izomery trans mają podobne lub identyczne podstawniki umieszczone po przeciwnych stronach wiązania podwójnego lub struktury pierścieniowej. Układ ten tworzy konfigurację geometryczną, w której podstawniki są bardziej od siebie oddalone w całej cząsteczce.
Terminy konformacja cis i trans odnoszą się konkretnie do przestrzennego rozmieszczenia podstawników wokół wiązania podwójnego lub w pierścieniu, niezależnie od ogólnej struktury cząsteczki. Terminy te są używane do opisania sposobu, w jaki podstawniki są zorientowane względem siebie pod względem ich położenia w poprzek wiązania podwójnego lub pierścienia.
Ustalenie, czy cząsteczka wykazuje izomerię cis czy trans, obejmuje analizę struktury molekularnej w celu zidentyfikowania pozycji podstawników wokół podwójnego wiązania lub pierścienia. Jeśli interesujące podstawniki znajdują się po tej samej stronie cząsteczki, jest to cis; jeśli są po przeciwnych stronach, jest to trans. Analiza ta pomaga w zrozumieniu właściwości fizycznych i chemicznych cząsteczki, ponieważ izomery cis i trans mogą mieć różną stabilność i interakcje ze względu na ich odmienny układ przestrzenny.
W chemii organicznej termin „syn” jest używany inaczej niż „cis”. Podczas gdy cis i trans szczegółowo opisują izomerię geometryczną wokół podwójnego wiązania lub pierścienia, „syn” ogólnie odnosi się do określonego układu przestrzennego, w którym podstawniki znajdują się po tej samej stronie cząsteczki. Termin ten ma szerszy zakres i może odnosić się do różnych struktur molekularnych, nie ograniczając się do tych wykazujących izomerię cis. Dlatego chociaż „syn” może czasami opisywać konfigurację cis, obejmuje szerszy zakres układów przestrzennych w cząsteczkach organicznych.
